用户手册

• 安装说明
  • 快速安装
    • unix系统下的安装
      • 依赖软件的安装
      • 安装 sagar 软件包
      • (option) jupyter notebook的安装
      • (option) 运行nose2执行单元测试
    • Windows系统下的安装
      • 依赖软件的安装
      • 安装Visual build tools
      • 下载 sagar 软件包
      • 安装 sagar 软件包
    • (option) 运行nose2执行单元测试
  • python虚拟环境
    • 为什么要使用python虚拟环境?
    • 什么是python虚拟环境?
    • 创建一个虚拟环境
• 使用说明
  • 命令行接口 rexpand 的使用
    • 子命令 rexpand cell 的使用
    • 子命令 rexpand conf 的使用
      • 各种体积的不等价超构型
      • 给定体积的不等价超构型
      • 特定胞的不等价构型
      • 特定分子和团簇结构的各种不等价构型
  • 通过jupyter notebook使用sagar
    • 简单函数的调用
      • 文件读写
      • 结构产生
    • 复杂结构的产生
      • 结构限制
      • 结构过滤
• 核心代码原理和背景
• 代码样列(script snippets)
• 进阶使用
  • Working with Aiida
  • sagar用作后处理
    • 基态相图的绘制
      • 计算相图边界处的结构
    • 能量评估函数的拟合
      • 能量的拟合
      • 电子结构的拟合